Prince of Persia: Les deux trônes est un jeu de plateforme d'aventure en XNUMXD avec un grand nombre d'énigmes et d'ennemis, qui s'inscrit dans la continuité des deux parties précédentes. Le prince de Perse, après avoir tué le gardien du Temps Dahakus, retourne à Babylone avec l'impératrice Kaileena, mais leur navire est attaqué alors qu'ils rentraient chez eux. Kaileena est capturée, où elle est tuée. Les Sables du Temps qui ont laissé le corps de la jeune fille tombent sur les blessures du Prince reçues au combat et créent son double sombre. Désormais, la tâche du prince est de vaincre son propre « moi » sombre et de libérer le royaume.