Prince of Persia: Die zwei Throne ist ein XNUMXD-Abenteuerplattformspiel mit einer großen Anzahl von Rätseln und Feinden, das eine Fortsetzung der beiden vorherigen Teile darstellt. Nachdem der Prinz von Persien den Wächter der Zeit Dahakus getötet hat, kehrt er mit der Kaiserin Kaileena nach Babylon zurück, aber ihr Schiff wird auf dem Heimweg angegriffen. Kaileena wird gefangen genommen, wo sie getötet wird. Der Sand der Zeit, der den Körper des Mädchens verlassen hat, fällt auf die Wunden des Prinzen, die er im Kampf erlitten hat, und erschafft sein dunkles Double. Nun ist es die Aufgabe des Prinzen, sein eigenes dunkles „Ich“ zu besiegen und das Königreich zu befreien.